分子動力学計算法を活用したタンパク質立体構造に基づく創薬支援技術とその応用

講師の言葉

　近年のタンパク質発現手法、結晶化、構造解析手法の進歩に伴い、多くのタンパク質の構造データが蓄積され、タンパク質立体構造情報に指南される創薬分子設計が注目されている。
　一方、「京」コンピューターに代表されるスーパーコンピュータや、GPUを用いた処理能力の高い低コストの汎用機の普及など、計算機技術を取り巻く環境も大きく変化しており、タンパク質立体構造に基づく創薬研究に計算科学技術が積極的に取り入れられている。
　その中でも、分子動力学計算法（MD）は、タンパク質の動的変化をとらえたタンパク質−リガンド結合シミュレーションや、高精度の相互作用エネルギー評価が見積れる要素技術として関心が高いが、実際にMDを始めるには、理論的背景の理解や具体的な手順、応用事例など敷居が高く、現実的には、多くの研究者が着手しづらい状況が続いている。
　本セミナーでは、MDの基礎から実行手順、創薬支援研究に利用する際の戦略、応用事例の解説などを通じて、創薬支援研究にMDを活用する技術が習得できるように構成している。

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